Das Jahresergebnis 2006 der AUA liegt mit einem Minus von 129,9 Millionen Euro leicht unter jenem von 2005, als ein Verlust von 129,1 Millionen Euro resultierte. Laut eigenen Angaben trugen die hohen Kerosin-Preise (Mehrkosten von 75,7 Mio. Euro) sowie Restrukturierungskosten auf der Langstrecke, die Rückstellungen bedingten, zu diesem unerfreulichem Ergebnis bei.
2006 nahm der Umsatz um 8,4% auf knapp 2,6 Milliarden Euro zu, die Passagier-Zahl um 9,4% auf über neun Millionen. Die Netto-Verschuldung konnte um 365 Millionen auf 715 Millionen Euro reduziert werden, und das Ergebnis vor Steuern und Abschreibungen war mit 8,3 Millionen Euro zwar noch im Minus, aber gegenüber 2005 um 43,7 Mio. Euro verbessert.
