Skyguide setzte 2006 CHF 341,1 Mio. um, was einem Rückgang von 3,6% entspricht. Der erneute Rückgang ist auf die tieferen Tarife bei einer nur leichten Steigerung des Verkehrsvolumens zurückzuführen, teilt die Unternehmung mit. Der Nettoertrag nach Gebührenabgrenzung betrug CHF 18,79 Millionen (2005: CHF 14.49 Mio.). Die Betriebsrechnung weist für 2006 eine Kostenunterdeckung von CHF 0,3 Mio. aus. Diese ist laut eigenen Angaben auf neue Investitionen im Bereich Sicherheit sowie Aufwendungen für die Single-European-Sky-Zertifizierung zurückzuführen.
