Erstmals seit ihrer Gründung hat die Regionalfluggesellschaft Intersky sieben Flugzeuge im Einsatz. Seit einigen Wochen neu im Einsatz ist eine 30-sitzige Embraer 120, die das Unternehmen eingeleast hat. Zur Flotte zählen weiterhin drei ATR72 mit je 70 Plätzen sowie drei Dash 8-Q300 mit je 50 Plätzen.
Im neuen Winterflugplan 2013/14 bleibt Intersky beim bestehenden Linien-Streckennetz. Ab Zürich bietet die Airline je zwei Rotationen nach Salzburg und drei Rotationen nach Graz an. Ab Friedrichshafen fliegt Intersky zweimal täglich nach Düsseldorf, Berlin und Hamburg. Dreimal täglich verbindet die Airline Karlsruhe und Hamburg.
